Xenogears combina la tradición y la innovación, usando sprites en 2D con fondos 3D, y dos sistemas de batalla distintos, uno de los cuales se basa en combos físicos de los personajes, y el segundo está basado en sistema de turnos con Gears. Además, Xenogears utiliza anime tradicional y películas CGI prerenderizadas para los momentos importantes de la historia.
Xenogears comienza en el continente de Ignas, donde las naciones de Av y Kislev están desde hace cientos de años en guerra. Existe una organización religiosa conocida como la ‘Iglesia’, que se dedica a preservar la cultura del mundo, ha encontrado en excavaciones unos robots gigantes llamados Gears. Los Gears son muy eficientes y pueden sustituir a los humanos en la Guerra. Aunque Kislev tiene muchas posibilidades de ganar la guerra, un misterioso ejercito llamado Geburah aparece y ayuda a Av. Con la ayuda de Geburah Av no solo se recupera, sino que aventaja a Kislev.
Siguiendo el libro “Perfect Works”, Xenogears el el quinto episodio de una serie de seis.